Respondido por email, pero añadimos la información para futuras consultas.

Primero se debe realizar un subdominio que apunte a la carpeta donde se aloje el dominio.

Por ejemplo:

Si se posee el dominio miejemplo.com, en la cuenta ejemplo.quijost.com y se desea ubicar en /public_html/mieje/

Se crea un subdominio del tipo mieje.ejemplo.quijost.com, con la ruta a /public_html/mieje/

Posteriormente se añade un dominio adicional o addon domain, con miejemplo.com y la ruta /public_html/mieje. Al estar establecido el subdominio, funcionara perfectamente miejemplo.com cargando los directorios de /public_html/mieje/